1990 m. rugsėjo 27 d. Lietuvos Respublikos teismų įsteigimo įstatymu Nr.1-621 vietoj veikiančio Skuodo rajono liaudies teismo įsteigtas Skuodo rajono teismas. Vėliau 1992 m. kovo 12 d. Lietuvos Respublikos apylinkių teismų įsteigimo įstatymu Nr. 1-2374 vietoje veikiančio Skuodo rajono teismo įsteigtas Skuodo rajono apylinkės teismas.
Skuodo rajono apylinkės teisme dirba trys teisėjai: Petronėlė Markauskienė, Henrikas Albertas Markavičius, Laimutė Bukauskienė (teismo pirmininkė), vienas teisėjo padėjėjas – Audronis Mažeika.
1990 metais teisme buvo išnagrinėta 66 baudžiamosios, 201 civilinė, 108 administracinės bylos. Pamažu išnagrinėtų bylų skaičius augo, 2002 – 2006 metais kasmet išnagrinėta apie 100 baudžiamųjų, 500 civilinių, 350 administracinių bylų, atlikta po 150 ikiteisminio tyrimo veiksmų. Taip pat nagrinėjami antstolių teikimai, skundai, pareiškimai, prašymai.
Tiek Skuodo rajonas, tiek apylinkės teismas yra vieni iš mažesnių. Nuo 1978 metų rugpjūčio mėnesio teismas glaudėsi Skuodo rajono policijos komisariato 230 kv. m ploto patalpose. 2005 m. gruodžio 13 d. Lietuvos teisingumo ministro įsakymu Nr.1R-398 Skuodo rajono apylinkės teismui perduotas valstybei nuosavybės teise priklausantis buvęs banko pastatas valdyti, naudoti ir disponuoti juo patikėjimo teise. 2007 m. lapkričio 13 d. komisija priėmė ir teismui perdavė rekonstruotas patalpas, esančias J. Basanavičiaus g. 15/Šatrijos g. 16, Skuodo mieste. Dabar Skuodo rajono apylinkės teismo darbuotojai persikėlė į naujas patalpas ir naudojasi 830 kv. m plotu. Tai neeilinis įvykis Skuodo rajono apylinkės teismo istorijoje, o pastatas papuošė Skuodo miestą.